El Patronato es el principal órgano de gobierno de la Fundación Itaka-Escolapios y dirige la Red de manera permanente entre las convocatorias de los Consejos Asesores.
Lo conforman Juan Alfonso Serra (Presidente), Jesús Elizari (Vicepresidente y Provincial de Emaús), Alberto Cantero (en nombre de la Fraternidad General y Secretario), Félicien Mouendji (en nombre de la Congregación General), Iván Ruiz (Provincial de Betania), Raúl González (Fraternidad de Emaús), Noemí Gesto (Fraternidad de Betania), Emmanuel Suárez y Carolina Paredes. También contó con la participación de Igor Irigoyen como coordinador general y de Ander Mijangos como coordinador del área de gestión de recursos.
